Продуманное расположение полов, решеток, устройств для сбора отходов позволяет сократить затраты труда при чистке клеток. Это очень важно, так как от трудоемкости обслуживания животных зависит в немалой степени и рентабельность кролиководческого хозяйства. Поэтому при строительстве крольчатника нужно предусмотреть возможность наиболее рационального размещения клеток и удобств для чистки помещения. Для чистки крольчатника с задней стороны необходимо ставить клетки подальше от стен. Если чистить крольчатник с передней стороны, то здесь необходимо рассчитывать на надежную канализацию, позволяющую мыть пол и сточные канавки водой с применением дезинфицирующего средства.
Для мелких индивидуальных хозяйств удобно иметь такое расположение закрытых помещений, в которых можно разместить крольчатники с любым количеством загонов, составленных, например, из двухэтажных секций, поставленных передней частью друг к другу, с проходом для чистки нижних полов под решетками с задней стороны, что создаст больше пространства.
Если кроличьи загоны расположить на солнечной стороне бывшей хозяйственной постройки или жилого здания, то в этом случае придется чистить клетки уже с передней стороны, куда выходят дверки отделений. Исходя из этого, выбирают и конструкцию крольчатника, В таких случаях удобна так называемая «навозная система», т. е. установка ящиков для навоза. Под решеткой спереди клетки подкладывают ящик, изготовленный из водоотталкивающей фанеры с щелями, залитыми смолой или резиноасфальтом. Эта система очень гигиенична и не трудоемка.